Một trong những nâng cấp quan trọng của bản Java 6 Beta 2 là việc bổ sung các framework hỗ trợ những ngôn ngữ kịch bản (script) phổ dụng như PHP.
Java SE 6, tên mã trước đây là "Mustang", đã được bổ sung đầy đủ các dịch vụ Web client hiện có, cùng việc hỗ trợ những đặc tả dịch vụ Web gần đây như JAX-WS 2.0 và JAXB 2.0. Ngoài ra, Java SE 6 cũng sẽ hỗ trợ cả phiên bản hệ điều hành sắp tới của Microsoft - Windows Vista.
Bản hoàn chỉnh của Java SE 6 (final) dự kiến sẽ được hoàn tất vào mùa thu này. Người dùng có thể download bản thử nghiệm của Java SE 6 tại website Developer Network của Sun.